采用氯對水進行消毒，主要就是通過其中HClO的氧化作用進行殺菌，因為次氯酸HClO是一個很小的中性分子，因此它能夠擴散到帶有負電的細菌的表面，然后穿透細菌的細胞壁進入到細菌的內部，發揮其氧化的作用對細菌內的酶系統進行破壞從而殺死細菌。
      大型的污水處理廠中一般使用液氯，是一種有毒的，腐蝕性很強的化學物質，因此，在對其進行運輸或是貯藏及使用的過程當中，我們都必須要嚴格的管理。

      氯制劑比起液氯來比較安全，但是漂白粉中有效的Cl很容易分解，造成使用的不方便性；NaClO不能夠貯藏，必須在現場使用，而且其產氣量也比較小，受到各方面的限制它的使用不是那么的普遍。

       Cl消毒能夠以較快的速度殺死水中存在的細菌，成本也不是很高，但是在Cl消毒的過程當中很容易產生一些有害的物質，這些經過氯化了的有機污染物，形成有機氯化物之后不僅使得水容易產生異味，而且這種污染物有毒并致癌，對人的生命安全造成威脅。

       ClO2是一種強氧化劑，它有很好的細胞壁吸附能力以及細胞壁的穿透能力，可以有效地快速地進入細菌內部對其酶系統進行破壞，從而達到快速殺菌的作用。

        因為ClO2是一種氧化劑，并不是氯化劑，因此，它與水中的很多有機物都不發生反應，如果反應也只是生成了氧化的產物，不會造成污染，ClO2的殺菌和消毒作用，要遠遠的超過運用Cl及氯化劑消毒。

       O3可以有效對水進行殺菌和消毒，其所產生的有害物質很少，同時能夠使水中溶解氧增加，實現水的脫色和去臭，能夠殺滅水中的藻類，也可以分解和氧化水中的Mn、洗滌劑、色素以及懸浮的顆粒和有機農藥，進而使得水質得到了大大的改善。

       這種方法的缺陷在于生產的設備比較龐大，生產的流程又比較復雜，對其運行和管理的水平要求也比較高，O3的制取生產率比較低，所消耗的電能也比較大，基礎建設投資大，成本比較高；除此之外，O3還是一種不穩定的氣體，很容易在水中分解。因此，單獨運用O3進行消毒很難保證持續性的殺菌消毒效果。

       紫外線能夠改變核糖核苷酸和脫氧核糖核苷酸中含氮的物質，它可以在相鄰的核苷之間形成二聚物產生新鍵，通過這種作用就可以致使水中的微生物不能夠實現自我的復制，從而達到了消毒的目的。

       運用紫外線對水進行消毒既方便又快捷。尤其是在水量較小的情況下能夠充分的發揮其優勢，即用低劑量在較短的時間內就能夠殺滅水中的細菌。紫外線消毒設備安裝比較容易，其管理和運行又都非常的方便，更重要的是運用紫外線進行水處理是一種物理處理，不會向水中增添新的物質，消毒后的水中也不會產生有毒副作用的產物。